Benedet, Fabrice

 

 portrait    

Fabrice Bénédet
ES - Forêts et Sociétés  TA C-105 / D
Campus international de Baillarguet
34398 Montpellier Cedex 5

Adresse mail : fabrice.benedet@cirad.fr

 

Compétences

Informatique (une sélection avec des exemples)

» Montage et gestion de projets.
» Analyse et conception : UML, Merise.
» Systèmes de gestion de bases de données : MySQL, PostgreSQL+Postgis, SQLServer, Access, etc.
» Langages : Java, Perl, PHP, XHTML, XML, XSLT, SQL, JavaScript.
» Logiciels : MSOffice, LibreOffice, Adobe® Web Prenium, Gimp, NetBean, Lazarus, Mapserver, GeoNetwork, R, LaTEX ...
» CMS : eZpublish, SPIP.
» Plates-formes d'e-formation : Ganesha, WBTManager.
» Serveurs : Apache, Tomcat, Thredds, INN, PWS.
» Systèmes : Mac ou PC (Windows, Linux).

Multimédia

» Conception, réalisation et gestion de systèmes d'information (SI, sites et portail Web).
» Création de cours en ligne (logiciels, progiciels) et d'animations multimédias à but pédagogique.
» Participation à la création de cédéroms pour l'IUFM.
» Encadrement et animation d'ateliers informatiques.
» Assistance des chercheurs et enseignants dans la définition de leurs projets multimédias.
» Photographie (macro) ; vidéo.

Recherche scientifique en Biologie

» Elaboration et conduite de projets pluridisciplinaires en Biologie.
» Collaboration avec des équipes de différents domaines de la Biologie.
» Choix et mise au point des techniques d'expérimentation.
» Mise en place des méthodes et des protocoles expérimentaux (laboratoire et terrain).

Encadrement et Formation

» Chercheurs, techniciens en Biologie.
» Chercheurs, enseignants, ingénieurs, stagiaires, élèves en Informatique et Multimédia.
» Mise en place d'une plate-forme e-formation. Développement de supports pédagogiques multimédias.

Communication

» Coordination d'équipes pour la mise en oeuvre de sites Web.
» Valorisation et diffusion des résultats (rapports, publications dans des revues scientifiques internationales à comité de lecture, colloques).
» Anglais scientifique (rédaction d'articles, veilles technologique et bibliographique)

 

Expérience professionnelle

Depuis 12/01/2009 - CIRAD - Ingénieur informaticien scientifique

Au sein de l'unité de recherche 105, "Forêts et Sociétés", j'interviens plus spécifiquement sur les missions suivantes :
» Montage et coordination de projets numériques
» Création de systèmes d'information et participation à l'évolution des bases de données de l'unité.
» Conception et développement d'applications métier.
» Conception et développement de Sites Web.
» Amélioration de la qualité des processus inhérents à la gestion des données.
» Formation et encadrement.

08/01/2007 au 30/09/2008 - IRD (UMR 212 Écosystèmes marins exploités) - Ingénieur informaticien

Développement d’un système d’informations (Web/base de données/outils de représentation et de traitements statistiques) permettant la mise à disposition de données environnementales océaniques et de distribution des prédateurs marins (observations discrètes, sorties de modèles, images satellites) destinées aux scientifiques.
» Interactions avec les scientifiques du projet et les informaticiens de la DSI.
» Etat de l’art.
» Définition et mise en oeuvre de l'architecture technique et fonctionnelle (architecture client/serveur n-tiers utilisant les servlets java, postgreSQL + PostGis, MapServeur, serveur Thredds, Logiciel R).
» Développement avec un collègue du SI .
» Rédactions de cahiers des charges pour des demandes de prestations.
» Rédactions d'appels à projet IRD « SPIRALES ».

15/10/2006 au 15/12/2006 - IRD (UMR 188 DIAPC) - Bioinformaticien

Analyse et conception d'un portail Web dédié à la génomique du caféier (postgreSQL, XML, RDF, PHP).
» Etat de l'art.
» Rédaction d’un cahier des charges.
» Développement d'un prototype.

01/09/2005 au 01/03/2006 - Manpower pour le CIRAD - Informaticien scientifique

Au sein du service de la Délégation aux Echanges Scientifiques et Internationaux j'ai assuré la maîtrise d'ouvrage et la maîtrise d'oeuvre des nouveaux sites Internet, Intranet et Extranet :
» Analyse du contexte interne et des besoins utilisateurs.
» Conception des sites et rédaction d'un cahier des charges.
» Développement graphique et technique.
» Rédaction de contenus.
» Tests et mise en production.
» Relation avec les équipes.
» Formations.

01/09/2004 au 01/01/2005 - CIRAD (unité architecture et services web) - Chef de projet web

Participation à la mise en oeuvre et à l'utilisation d'un outil de gestion de contenus Web (CMS open-source eZpublish).
» Prise en main et développement d'extension pour l'outil.
» Conception, réalisation et gestion du déploiement de "sites pilotes" en m'appuyant sur une équipe spécifique (responsable communication, graphiste, webmestre, programmeur).
» Définition des méthodes facilitant et fiabilisant la production multimédia.
» Suivi de la mise en place des procédures de déploiement au niveau inter-équipes.
» Rédaction de documentations et formations délivrées aux agents utilisateurs.

01/10/2003 au 01/08/2004 - CIRAD (équipe multimédia) - Chef de projet & développeur web

Ma principale activité a été de concevoir et réaliser des produits multimédias :
» Analyse des besoins auprès des équipes de recherche (informations à gérer, architecture du produit, ergonomie).
» Conception de sites Web.
» Prise en charge des phases de réalisation (animation d'une équipe comprenant graphiste, développeur, chargé de communication et moi même), de tests, suivi des mises en production et gestion des retours.
» Formations et rédaction de documentations.

01/06/2003 au 01/09/2003 - Cogitis - Informaticien stagiaire

Expérience dans le domaine de l'enseignement à distance. Suite à une étude sur les principales plates-formes de formation à distance disponibles sur le marché (commerciales / open-sources) j'ai identifié, sélectionné (analyse comparative) et mis en place une plate-forme open-source de gestion de formations à distance (Ganesha).

01/11/1999 au 01/09/2001 - CERTEM - IUFM - Formateur NTIC

Formateur aux nouvelles technologies de l'information et de la communication éducatives au sein de la cellule multimédia de l'IUFM de Paris.
» Identification des besoins dans des écoles pilotes.
» Formations en informatique délivrées aux différents usagers de l'IUFM.
» Assistances dans des écoles, accompagnements des enseignants.
» Maintenance informatique.
» Production d'outils pédagogiques : sites Web, cédéroms.

01/09/1994 au 01/07/1999 - Organismes de recherche (IRBI France, IRD Congo) - Chercheur-doctorant et coopérant en Biologie

Mes activités de recherche se sont inscrites dans le contexte général des interactions chimiques présentes dans des systèmes ravageurs de plantes / auxiliaires (insectes) lors des phases de recherche et " d'acceptation " de l'hôte par leurs ennemis naturels. Les signaux chimiques intervenant dans ces interactions, à savoir depuis leur origine (au niveau du ravageur-hôte) avec leur perception, jusqu'à leur expression comportementale (au niveau de l'auxiliaire) ont été identifiés et caractérisés selon une approche pluridisciplinaire.
» Collaboration avec plusieurs équipes disciplinaires.
» Choix et mise au point des techniques d'expérimentation.
» Elaboration et mise en place des méthodes et des protocoles expérimentaux (laboratoire et terrain).
» Réalisation d'expériences utilisant de nombreuses techniques de la biologie moléculaire, la biochimie, l'électrophysiologie, la microscopie et du comportement.
» Valorisation des résultats lors de communications écrites (publications en langue anglaise dans des revues internationales à comité de lecture), affichées (posters) et orales (colloques nationaux et internationaux).
» Encadrement des activités de techniciens en Biologie Moléculaire.

Formation

2003 : DESS Informatique Appliquée aux Organisations (Université Montpellier II - Montpellier). Système & Réseaux, langage de programmation, SI et bases de données, IHM, multimédia...

1999 : Doctorat en Sciences de la Vie, spécialité : biologie des populations et entomologie (Université François Rabelais - Tours)

1994 : DEA de biologie des populations et éco-éthologie (Université François Rabelais - Tours)

 

Réalisations informatiques et Multimédia

Publication 


» Plechakova, O., Tranchant-Dubreuil, C., Bénédet, F., Couderc, M., Tinaut, A., Viader, V., De Block, P., Hamon, P., Campa, C., De Kochko, A., Hamon, S., Poncet, V. 2009. BMC Plant Biology

Applications & sites Web (une sélection)

» Systèmes d’informations pour l'unité Forêts et Sociétés et les projets, auteur.
» Logiciels de collecte de données pour les projets DynAfFor, P3FAC, PPFNC, auteur.
» Système d’apurement et de collecte de données pour l'UMR EcoFog, auteur.
» Base de données mondiales d'indicateurs nationaux et Outil de visualisation et d'aide à la décision, auteur.
» Système d’information pour ANR Remige, co-auteur.
» Portail web d’intégration (prototype) pour l’IRD, auteur. 
» Sites web pour le Cirad, auteur et co-auteur.
» Plate-forme de gestion de contenus (CMS eZpublish) : participation à la mise en production pour le Cirad, co-auteur. 
» Deux sites web au cours du DESS, co-auteur. 
» Plate-forme d’e-formation «Ganesha», auteur. 
» Sites répondant aux besoins d'écoles et de l'IUFM (HTML), auteur. 
» Deux sites web en qualité de travailleur indépendant, auteur. 
» Cédérom pour l’IUFM de Paris, co-auteur.

Projets

» Projets IRD "Spirales" 2007 et 2008 pour un appui de la DSI aux activités de recherche en matière d’informatique scientifique, co-auteur et auteur.

Rapports (une sélection)

» Rapport - mission d'assistance technique court terme N° C3.3-02: "Informatisation de l’inventaire annuel du dispositif de Mokabi S.A.", (AFD) - co-auteur.
» "Acquisition de données d’inventaires : retour d’expérience sur les aspects techniques période 2010-2020", (Cirad) - auteur.
» "Rapport d’audit de la plateforme Globallometree pointant les risques liés à la situation actuelle et préconisant des pistes d’évolution", (Cirad) - co-auteur.
» "Métadonnées disciplinaires : comment créer un contexte fédérateur ?", (Cirad) - auteur.
» "Base de données et logiciel de visualisation d'indicateurs mondiaux", (Cirad) - auteur.
» "Construction d’interfaces graphiques : exemple du logiciel d’apurement des données d’inventaires", (Cirad) - auteur.
» "Construction d’interfaces graphiques : exemple du logiciel de saisie des données d’inventaires pour pocketpc", (Cirad) – co-auteur.
» "Analyse, conception et mise en oeuvre d'un système d'information (Web/base de données), d’outils graphiques et de traitements permettant de mettre à disposition de la communauté scientifique de façon centralisée des données environnementales océaniques et de distribution des prédateurs marins (observations discrètes, sorties de modèles, images satellites)", (IRD), co-auteur.
» "Mise en oeuvre d’un Portail Web dédié à la génomique du caféier pour une mutualisation des ressources ( + des connaissances)", (IRD) - auteur.
» "Analyse et mise en place d’une plate-forme de gestion de formations" (société Cogitis), auteur.
» "Analyse et modèle de mise à jour du système d’information de Skuld-Tech" (société Skuld-Tech), co-auteur.
» "Gestion d'une conférence" et "Les News Usenet" (DESS), co-auteur.

Communication affichée

» Fortuno S., Pichot C., Bénédet F.,  Congrès du lancement scientifique du programme de recherche PEPR FORESTT – Bordeaux, juin 2024

Réalisations scientifiques

Publications et livre

» Bénédet F., Gourlet-Fleury S., Allah-Barem F., Baya F., Beina D., Cornu G., Dimanche L., Dubiez E., Forni E., Freycon V., Mortier F., Ouédraogo D.-Y., Picard N., Rossi V., Semboli O., Yalibanda Y., Yongo-Bombo O., Fayolle A.. 2024. Scientific Data.
» Fortuno et al.. 2024. Plan de Gestion de Données - Projet NUM-DATA (version 1).
» Sullivan Megan K., Vleminckx J., Mouguiama Bissiemou Prince A., Niangadouma R., Ilambi M. M., Lemeilleur T. J., Bénédet F., Abernethy K. A., Queenborough S. A., Comita L. S.. 2024.  Global Ecology and Conservation.
» Ehouman E., Bénédet F., Herault B.. 2023. Plan de Gestion de Données - Projet Terri4Sol (version 1).
» Sigal-Guille C., Demenois J., Chevallier T., Bénédet F., Le Bas C., Bispo A., Corbiere P.. 2023. Etude et Gestion des Sols.
» Penel B., Freycon V., Marcon E., Rossi V., Cornu G., Bénédet F., Forni E., Gourlet-Fleury S.. 2022. Journal of Tropical Ecology.
» Demenois J., Bénédet F.. 2022. Plan de Gestion de Données - Projet ANR DATA4C+.
» Fujisaki K., Chevallier T., Bispo A., Laurent J.B., Thévenin F., Chapuis-Lardy L., Cardinael R., Le Bas C., Freycon V., Bénédet F., Tella M., Demenois J.. 2022. Livrable ANR DATA4C+.
» forestplots.net, et al. 2021. Biological Conservation.
» Picard, N., et al. 2021. Frontiers in Ecology and Evolution.
» Réjou-Méchain, M., et al. 2021. Nature.
» Unité de recherche Forêts & Sociétés. 2021. Vivre avec les forêts tropicales.
» Hubau, W., Lewis,S.L., et al. 2020. Nature.
» Herault, B., N'Guessan Kanga, A., et al. 2020. Forest Ecology and Management.
» Ploton, P., Mortier, F.,et al. 2020. Scientific Data.
» Forni, E., Rossi, V., Gillet, J.F., Bénédet, F., Cornu G., Freycon, V., Zombo, I., Alberny, E., Mayinga, M., Istace, V., Gourlet-Fleury, S.. 2019. Bois et Forêts des Tropiques.
» Claeys, F., Gourlet-Fleury, S., Picard, N., Ouédraogo, D., Tadesse, M., Hérault, B., Baya, F., Bénédet, F., Cornu, G. and Mortier, F. 2019. Environmental Research Letters.
» Ouédraogo, D., Fayolle, A., Gourlet-Fleury, S., Mortier, F., Freycon, V., Fauvet, N., Rabaud, S., Cornu, G., Bénédet, F., Gillet, J.-F., Oslisly, R., Doucet, J.-L., Lejeune, P. and Favier, C. 2016. Journal of Ecology.
» Gond V., Cornu G., Viennois G., Betbeder J., Rejou-Mechain M., Fayolle A., Gourlet-Fleury S., Baghdadi N., Barbier N., Mortier F., Bénédet F., Doumenge C. 2016. UNESCO. 
» Gond V., Betbeder J., Fayolle A., Viennois G., Cornu G., Rejou-Mechain M., Baghdadi N., Bénédet F., Doumenge C., Gourlet-Fleury S. 2015. Annual World Bank Conference on Land and Poverty.
» Plinio Sist & Co. 2015. Applied Vegetation Science.
» Fayolle, A., Picard, N., Doucet, J.-L., Swaine, M., Bayol, N., Bénédet, F., Gourlet-Fleury, S. 2014. Forest Ecology and Management.
» Mortier, F., Ouédraogo, D.-Y., Claeys, F., Tadesse, M., Cornu, G., Baya, F., Benedet, F., Freycon, V., Gourlet-Fleury, S., Picard, N. 2015. Environmetrics.
» Gourlet-Fleury, S., Beina, D., Fayolle, A., Ouédraogo, D.-Y., Mortier, F., Bénédet, F., Closset-Kopp, D., Decocq, G. 2013. Forest Ecology and Management.
» Gourlet-Fleury, S., Mortier, F., Fayolle, A., Baya, F., Ouédraogo, D.-Y., Bénédet, F., Picard, N. 2013. Phil Trans B issue.
» Gauthier, N., Renault, S., Mandon, N., Bénédet, F. 2004. Journal of Insect Physiology.
» Bénédet, F., Leroy, T., Gauthier, N., Thibaudeau, C, Thibout, E., Renault, S. 2002. Proceedings of the Royal Society of London B.
» Renault, S., Petit, A, Bénédet, F., Bigot, S., Bigot, Y. 2002. Journal of Insect Physiology.
» Gauthier, N, Bénédet, F., Tricault, Y, Monge, J. P., Huignard, J 2002. Journal of Insect Behavior.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Renault, S., Pouzat, J., Thibout, E., 1999. Journal of Insect Physiology.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Renault, S., Pouzat, J., Thibout, E., 1999. Annales de la Société Entomologique de France.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Pouzat, J., Thibout, E., 1997. Actes des colloques de la SFECA

Mémoires & rapports (une sélection)

» Rapport technique : "bilan offre/demande de la ressource bois-énergie dans le bassin d’approvisionnement de Bangui", (Cirad) - co-auteur.
» Thèse : "Modalités de reconnaissance d'un ravageur, Acrolepiopsis assectella, par son parasitoïde, Diadromus pulchellus : identification et perception d'un signal polypeptidique", auteur.

» "Variation de la sensibilité chimique périphérique chez les Insectes", auteur.
» "Un aspect débattu du rôle des protéines antennaires spécifiques de l'olfaction". auteur.
» "Influence de l'hormone juvénile dans la mise en place des structures du lobe antennaire de l'abeille, Apis mellifera", auteur.

Communications orales

» Bénédet, F., Renault, S., Bigot, Y. et Thibout, E., 27ième journée des entomophagistes, Amiens, 9-10 Mars 1999.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Renault, S., Pouzat, J. et Thibout, E. IVième conférence internationale francophone d’entomologie, Saint-Malo, 5-9 Juillet 1998.
» Bénédet, F., Fauria, K., Thibout, E., 25 ième journée des entomophagistes, Amboise, 30-31 Mars 1995.
» Thiery, D., Gabel, B., Bénédet F., 24ième journée des entomophagistes, Aussois, 7-8 Avril 1994.

Communications affichées

» Bénédet, F., Leroy, T., Gauthier, N., Biémont, J-C & Thibout, E , 16th Meeting of the International Society of Chemical Ecology – Marseille, Novembre 1999.
» Bénédet, F., Pouzat, J. et Thibout, E., Forum de l’Ecole Doctorale – Tours, 22 Avril 1996.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Pouzat, J. et Thibout, E., 29ième colloque de la SFECA – Albi, 19-21 Mars 1997.
» Bénédet, F., Bigot, Y., Pouzat, J. et Thibout, E., 10ième colloque Biotechnocentre – Seillac II, 6-7 Novembre 1997.