Offres de stages et thèses Amélioration génétique

 

2019

Terminé (recrutement d'étudiants dans le cadre du projet GENES de l'UE)

  

2018

Offre publiée le 16 mars 2018 - Terminé

Offre de stage M2 "BOV" UY1, sélection génomique palmier à huile - cliquez ici pour les détails

Candidature à adresser à : david.cros@cirad.fr

 

2017

Offres publiées le 6 janvier 2017 / Terminé

Offre de thèse de doctorat en génétique quantitative / amélioration des plantes, démarrage septembre 2017, 3 ans, avec indemnités, à l'université de Yaoundé 1.

MISE A JOUR 12 juin 2017 : offre close - doctorant recruté (Achille NYOUMA, Faculté des Sciences)

MISE A JOUR 27 mars 2017 : l'épreuve pour identifier le candidat retenu aura lieu le lundi 15 mai 2017 (14h-16h)

Sujet :  Extension des possibilités de la sélection génomique chez le palmier à huile par l’intégration de données moléculaires individuelles d’hybrides (détail disponible en cliquant ici)

Mots-clés : modèle linéaire mixte, génotypage, statistiques, programmation R, palmier à huile, génomique

Conditions et procédure de candidature :

• titulaire d'un diplôme de niveau Master 2 ou équivalent (en biostatistiques, génétique, mathématiques appliquées, etc), permettant une inscription en thèse à l'université Yaoundé, avec une moyenne d'au moins 2.4/4
• maîtrise du langage R, ou d'un autre langage de programmation (Fortran, C, etc) et volonté d'apprendre R
• capacités rédactionnelles en français et / ou anglais
• connaissances en statistiques (analyses de variance, régression linéaire, etc) ; et éventuellement modèle linéaire mixte
• compréhension de l'anglais scientifique (pour lecture d'articles)
  
• connaissances en génétique et biologie appréciées

Contactez-moi si vous êtes intéressé(e)s, en adressant lettre de motivation et CV à l'adresse david.cros@cirad.fr. Les candidats présélectionnés seront invités à participer à un concours (le 15 mai 2017) permettant de faire la sélection finale du doctorant.

Pour vous préparer, je vous invite si besoin à vous entrainer à R. Il y a pour cela de nombreux sites qui permettent d'apprendre seul (par exemple, ici et là). Vous pouvez aussi regarder mon powerpoint d'initiation et les quelques exercices qui vont avec (a, b, c). Pour la génétique quantitative nécessaire à cette thèse, vous pouvez lire ce brouillon de document.

   

Offre de stage de master 2 (6 mois, à partir de juin 2017) : sélection génomique chez l'hévéa / pourvu

  (suite du stage effectué en 2016, ci-dessous - statistiques appliquées, génétique, programmation R)

      

2016

Publié le 15 octobre 2015 / Terminé.

4 stages rémunérés sont proposés aux étudiants de niveau Master 2 de l'université Yaoundé 1 (6 mois), en particulier aux étudiants de la Faculté des Sciences (plutôt sujets 3 et 4) et de l'Ecole Polytechnique (plutôt sujets 1 et 2).

Candidature à adresser à : david.cros@cirad.fr

 

- Title: Investigating genomic selection in oil palm with computer simulations

- Keywords: R programming, linear mixed model, quantitative genetics                      See details 

   

- Title: Breeding oil palm to improve the regularity of production along the year

- Keywords: R programming, linear mixed model, quantitative genetics and genomics      See details

   

- Title: Comparison of genetic parameters estimated from SSR markers and genotyping-by-sequencing in oil palm breeding populations

- Keywords: plant breeding, population genetics and genomics, R programming                See details

 

  - Title: Genomic selection in rubber tree

- Keywords: plant breeding, quantitative genetics and genomics, R programming           See details