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• UMR BGPI (Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite)
• Equipe BECφ (Biologie Evolutive des Champignons Phytopathogènes)
• TAA-54/K-Campus International de Baillarguet-34398 Montpellier Cedex 5
• Téléphone: +33 4 99 62 48 10
• Télécopie: +33 4 99 62 48 48
• Adresse e-mail : virginie.ravigne#cirad.fr
• 2007- Chercheuse CIRAD -UMR BGPI
• 2005- 2006 Maître de conférences UPPA - UMR ECOBIOP Responsable pédagogique de la première année de Licence Biologie des Organismes de l'UFR Sciences et Techniques de la Côte Basque
• 2004- 2005 Post-doc et Première assistante dans le Département Ecologie et Evolution (Université de Lausanne) avec L.Keller
• 2000- 2003 Thèse en Biologie Evolutive, Université Montpellier 2 avec I.Olivieri
• 1999- 2000 DEA Biologie de l'Evolution et Ecologie, Université Montpellier 2 avec I. Olivieri
• 1997- 2001 Ecole Normale Supérieure, Paris
L'agriculture regorge malheureusement d'exemples de populations de bio-agresseurs, qui après une phase de stagnation plus ou moins longue, contournent finalement les résistances des variétés cultivées et/ou les pesticides utilisés et diminuent leur impact. Ces exemples montrent que l'évolution des populations de bio-agresseurs peut avoir des conséquences majeures sur les agrosystèmes en ruinant les efforts déployés pour développer ces résistances et/ou ces moyens de lutte et mettant en difficulté les producteurs. Ainsi l'amélioration des pratiques culturales et des résistances variétales passe par une meilleure compréhension des processus d'adaptation des bio-agresseurs. Dans ce cadre, mes recherches ont visent à produire des connaissances fondamentales sur la biologie évolutive des champignons phytopathogènes. Je développe ainsi des approches théoriques et apporte mon soutien sur des approches empiriques de l'équipe visant à comprendre :
• les processus modelant le potentiel adaptatif (histoire des populations, flux de gènes contemporains et recombinaison),
• les contraintes génétiques sur les traits d'intérêts (bases génétiques, relations entre les traits),
• la réponse à la sélection.
• 2011-2014 Projet Agropolis Fondation BIOFIS. Coordonné par A. Estoup & J.-Y. Rasplus (INRA - UMR CBGP). Responsable de la tâche « Evolution théorique des espècesenvahissantes : développement deconcepts, d’outils de modélisation analytique et de simulation pour mieuxcomprendre les processus stochastiques et adaptatifs en jeu durant l’invasion »
• 2009-2012 Projet ANR Blanc EMILE « Etude des Méthodes d'Inférence et Logiciels pourl'Evolution » coordonné par J.-M. Cornuet (INRA - UMR CBGP). Responsable de la tâche « Extension des méthodes d'inférence aux espèces non standard »
• 2009-2010 Coordination du Projet Agropolis Fondation « Small Grant » ModPEA « Dynamics and evolution of life history traits in plant pathogens and pests »
• 2008-2011 Projet ANR Biodiversité EMERFUNDIS « Comprendre les émergences de maladies fongiques de plantes : vers une estimation des risques liés aux changements globaux » coordonné par J. Carlier (CIRAD - UMR BGPI)
• 2008-2011 Projet ATF « Management and reversibility of fungicide resistance in populations of Mycosphaerella fijiensis, causal agent of Black Leaf Streak Disease of bananas and plantains » coordonné par L. de Lapeyre de Bellaire(CIRAD - UPR Systèmes de culture bananes, plantains et ananas)
20. Rieux, A., Lenormand, T., Carlier, J., de Lapeyre de Bellaire, L. & V. Ravigné. 2013. Using neutral cline decay to estimate contemporary dispersal: a generic tool and its application to a major crop pathogen. Early-view in Ecology Letters. LIEN
19. Tayeh, A., Estoup, A. Hufbauer, R., Ravigné, V., Goryacheva, I., Zakharov, I., Lombaert, E., & B. Facon. 2013. Investigating the genetic load of an emblematic invasive species: The case of the invasive harlequin ladybird Harmonia axyridis. Accepted in Ecology and Evolution. PDF
18. Rieux, A., de Lapeyre de Bellaire, L., Zapater, M.-F., Ravigné, V., and J. Carlier. 2012. Recent range expansion and agricultural landscape heterogeneity have only minimal effect on the spatial genetic structure of the plant pathogenic fungus Mycosphaerella fijiensis. Heredity 110:29-38.
17. Barrès, B., Carlier, J., Seguin, M., Fenouillet, C., Cilas, C., & V. Ravigné. 2012. Understanding the recent colonization history of a plant pathogenic fungus using population genetic tools and Approximate Bayesian Computation. Heredity 109:269-279. LIEN
16. Dutech, C., Barrès, B., Bridier, J., Robin, C., Milgroom, M. & V. Ravigné. 2012. The Chestnut Blight Fungus World Tour: successive introduction events from diverse origins in an invasive plant fungal pathogen. Molecular Ecology 21:3931-3946. LIEN + News & Views Mol Ecol
15. Saleh, D., Xu, P., Shen, Y., Li, C., Adreit, H., Milazzo, J., Ravigné, V., Bazin, E., Nottéghem, J.-L., Fournier, E. & D. Tharreau. 2012. Sex at the origin: an Asian population of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae reproduces sexually. Molecular Ecology 21:1330-1344 LIEN
14. Robert, S., Ravigné, V., Zapater, M.-F., Abadie, C. & J. Carlier. 2012. Contrasting introduction scenarios among continents in the worldwide invasion of the banana fungal pathogen Mycosphaerella fijiensis. Molecular Ecology 21(5): 1098-1114 LIEN + BBC Nature News
13. Hufbauer, R. A., Facon, B., Ravigné, V., Turgeon, J., Foucaud, J., Lee, C. E., Rey, O., & A. Estoup. 2012. Anthropogenically-Induced Adaptation to Invade (AIAI): Contemporary adaptation to human-altered habitats within the native range can promote invasions. Evolutionary Applications 5(1): 89-101 LIEN
12. Rieux, A., Halkett, F., de Lapeyre de Bellaire, L., Zapater, M.-F., Rousset, F., Ravigné, V., and J. Carlier. 2011. Inferences on pathogenic fungus population structures from microsatellite data: an original landscape genetics approach reveals traces of historical events. Molecular Ecology 20: 1661-1674. LIEN
11. Cornuet, J.-M., Ravigné, V. & A. Estoup. 2010. Inference on population history and model checking using DNA sequence and microsatellite data with the software DIYABC(v1.0). BMC Bioinformatics, 11: 401. PDF
10. Ravigné, V., Dieckmann, U., & I. Olivieri. 2009. Live where you thrive: Joint evolution of habitat choice and local adaptation facilitates specialization and promotes diversity. The American Naturalist, 174 (4): E141-E169. PDF
9. Pariaud, B., Ravigné V., Halkett F., Goyeau H., Carlier J., Lannou C. 2009. Aggressiveness and its role in the adaptation of fungal plant pathogens. Plant Pathology, 58 (3): 409-424. LIEN
8. Labonne, L., V. Ravigné, B. Parisi and C. Gaucherel. 2008. Linking dendritic network structures to population demogenetics: The downside of connectivity. Oikos 117:1479-1490. LIEN
7. Lehmann, L., V. Ravigné, and L. Keller. 2008. Population viscosity can promote the evolution of altruistic sterile helpers and eusociality. Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences 275:1887-1895. LIEN
6. Facon, B., V. Ravigné, and J. Goudet. 2008. Gender-role alternation in the simultaneously hermaphroditic freshwater snail Physa acuta: not with the same partner. Behavioral Ecology and Sociobiology 62:713-720. LIEN
5. Facon, B., V. Ravigné, L.Sauteur, and J. Goudet. 2007. Effect of mating history on gender preference inthe hermaphroditic snail Physa acuta. Animal Behaviour 74:1455-1461. LIEN
4. Facon, B., V. Ravigné, and J. Goudet. 2006. Experimental evidence of inbreeding avoidance in the hermaphroditic snail Physa acuta. Evolutionary Ecology 20:395-406. LIEN
3. Ravigné, V. 2006. Selective interactions between short-distance pollen and seed dispersal in self-compatible species (vol 60, pg 2260, 2006). Evolution 60:2666-2666.
3bis. Ravigné, V., I. Olivieri, S. C. Gonzalez-Martinez, and F. Rousset. 2006. Selective interactions between short-distance pollen and seed dispersal in self-compatible species. Evolution 60:2257-2271. LIEN
2. Ravigné, V., I. Olivieri, and U. Dieckmann. 2004. Implications of habitat choice for protected polymorphisms. Evolutionary Ecology Research 6:125-145 PDF
1. Kirkpatrick,M., and V. Ravigné. 2002. Speciation by natural and sexual selection: Models and experiments. The American Naturalist 159:S22-S35. LIEN
1. BarberousseA., Bierne N., Britton-Davidian J., Capy P., Desdevises Y., Giraud, T.,Jousselin E., Moulia C., Ravigné V., Samadi S., Smadja C. 2010. La spéciation. In: Thomas F., Lefèvre T., Raymond M., Biologie Evolutive : De Boeck. LIEN
Liste CIRAD des publications de Virginie Ravigné
I regularly teach about the foundations of evolutionary biology, evolutionary genetics, game theory, adaptive dynamics, the evolution of life history traits and population genetics.
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