Cirad

Virginie Ravigné

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Affectation

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               Département BIOS

               UMR BGPI (Biologie et Génétique des Interactions Plante-Parasite)

               Equipe BECφ (Biologie Evolutive des Champignons Phytopathogènes)

 

Coordonnées

               TAA-54/K-Campus International de Baillarguet-34398 Montpellier Cedex 5

               Téléphone: +33 4 99 62 48 10

               Télécopie: +33 4 99 62 48 48

               Adresse e-mail : virginie.ravigne#cirad.fr

 

Parcours

               2007-          Chercheuse CIRAD -UMR BGPI

               2005- 2006  Maître de conférences UPPA - UMR ECOBIOP Responsable pédagogique de la première année de Licence Biologie des Organismes de l'UFR Sciences et Techniques de la Côte Basque

               2004- 2005  Post-doc et Première assistante dans le Département Ecologie et Evolution (Université de Lausanne) avec L.Keller

               2000- 2003  Thèse en Biologie Evolutive, Université Montpellier 2 avec I.Olivieri

               1999- 2000  DEA Biologie de l'Evolution et Ecologie, Université Montpellier 2 avec I. Olivieri

               1997- 2001  Ecole Normale Supérieure, Paris

 

Activités de recherche

L'agriculture regorge malheureusement d'exemples depopulations de bio-agresseurs, qui après une phase de stagnation plus ou moins longue, contournent finalement les résistances des variétés cultivées et/ou les pesticides utilisés pour diminuer leur impact. Ces exemples montrent que l'évolution des populations de bio-agresseurs peut avoir des conséquences majeures sur les agrosystèmes en ruinant les efforts déployés pour développer ces résistances et/ou ces moyens de lutte et mettant en difficulté les producteurs. Ainsi l'amélioration des pratiques culturales et des résistances variétales passe par une meilleure compréhension des processus d'adaptation des bio-agresseurs. Dans ce cadre, mes recherches ont visent à produire des connaissances fondamentales sur la biologie évolutive des champignons phytopathogènes. Je développe ainsi des approches théoriques et apporte mon soutien sur des approches empiriques de l'équipe visant à comprendre :

               les processus modelant le potentiel adaptatif (histoire des populations, flux de gènes contemporains et recombinaison),

               les contraintes génétiques sur les traits d'intérêts (bases génétiques, relationsentre les traits),

               la réponse à la sélection.

 

Projets en cours

               2011-2014 Projet Agropolis Foundation BIOFIS. Coordonné par A. Estoup & J.-Y. Rasplus (INRA - UMR CBGP). Responsable de la tâche « Evolution théorique des espècesenvahissantes : développement  deconcepts, d’outils de modélisation analytique et de simulation pour mieuxcomprendre les processus stochastiques et adaptatifs en jeu durant l’invasion »

               2009-2012 Projet ANR Blanc EMILE « Etude des Méthodes d'Inférence et Logiciels pourl'Evolution » coordonné par J.-M. Cornuet (INRA - UMR CBGP). Responsable de la tâche « Extension des méthodes d'inférence aux espèces non standard »

               2009-2010 Coordination du Projet Agropolis Foundation « Small Grant » ModPEA « Dynamics and evolution of life history traits in plant pathogens and pests »

               2008-2011 Projet ANR Biodiversité EMERFUNDIS « Comprendre les émergences de maladies fongiques de plantes : vers une estimation des risques liés aux changements globaux » coordonné par J. Carlier (CIRAD - UMR BGPI)

               2008-2011 Projet ATF « Management and reversibility of fungicide resistance in populations of Mycosphaerella fijiensis, causal agent of Black Leaf Streak Disease of bananas and plantains » coordonné par L. de Lapeyre de Bellaire(CIRAD - UPR Systèmes de culture bananes, plantains et ananas)

 

Publications

Articles parus dans des revues à comité de lecture

1.     Dutech, C., Barrès, B., Bridier, J., Robin, C., Milgroom, M. & V. Ravigné. 2012. The Chestnut Blight Fungus World Tour: successive introduction events from diverse origins in an invasive plant fungal pathogen. Early-view in Molecular Ecology. LIEN

2.         Saleh, D., Xu, P., Shen, Y., Li, C., Adreit, H., Milazzo, J., Ravigné, V., Bazin, E., Nottéghem, J.-L., Fournier, E. & D. Tharreau. 2012. Sex at the origin: an Asian population of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae reproduces sexually. Early-view in Molecular EcologyLIEN

3.        Robert, S., Ravigné, V., Zapater, M.-F., Abadie, C. & J. Carlier. 2012. Contrasting introduction scenarios among continents in the worldwide invasion of the banana fungal pathogen Mycosphaerella fijiensis. Molecular Ecology 21(5): 1098–1114 LIEN

4.     Hufbauer, R. A., Facon, B., Ravigné, V., Turgeon, J., Foucaud, J., Lee, C. E., Rey, O., & A. Estoup. Anthropogenically-Induced Adaptation to Invade (AIAI): Contemporary adaptation to human-altered habitats within the native range can promote invasions. Evolutionary Applications 5(1): 89–101 LIEN

5.          Rieux, A., Halkett, F., de Lapeyre de Bellaire, L., Zapater, M.-F., Rousset, F., Ravigné, V., and J. Carlier. 2011. Inferences on pathogenic fungus population structures from microsatellite data: an original landscape genetics approach reveals traces of historical events. Molecular Ecology 20: 1661–1674. LIEN

6.           Cornuet, J.-M., Ravigné, V. & A. Estoup. 2010. Inference on population history and model checking using DNA sequence and microsatellite data with the software DIYABC(v1.0). BMC Bioinformatics, 11: 401. PDF 

7.           Ravigné, V., Dieckmann, U., & I. Olivieri. 2009. Live where you thrive: Joint evolution of habitat choice and local adaptation facilitates specialization and promotes diversity. The American Naturalist, 174 (4): E141-E169. PDF

8.          Pariaud, B., Ravigné V.,Halkett F., Goyeau H., Carlier J., Lannou C. 2009. Aggressiveness and its role in the adaptation of fungal plant pathogens. Plant Pathology, 58 (3): 409-424. LIEN

9.           Labonne, L., V. Ravigné, B. Parisi and C. Gaucherel.2008. Linking dendritic network structures to population demogenetics: The downside of connectivity. Oikos 117:1479-1490. LIEN

10.           Lehmann, L., V. Ravigné, and L. Keller. 2008. Population viscosity can promote the evolution of altruistic sterile helpers and eusociality. Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences 275:1887-1895. LIEN

11.           Facon, B., V. Ravigné, and J. Goudet. 2008. Gender-role alternation in the simultaneously hermaphroditic freshwater snail Physa acuta: not with the same partner. Behavioral Ecology and Sociobiology 62:713-720. LIEN

12.           Facon, B., V. Ravigné, L.Sauteur, and J. Goudet. 2007. Effect of mating history on gender preference inthe hermaphroditic snail Physa acuta. Animal Behaviour 74:1455-1461. LIEN

13.         Facon, B., V. Ravigné, and J. Goudet. 2006. Experimental evidence of inbreeding avoidance in the hermaphroditic snail Physa acuta. Evolutionary Ecology 20:395-406. LIEN

14.         Ravigné, V. 2006. Selective interactions between short-distance pollen and seed dispersal in self-compatible species (vol 60, pg 2260, 2006). Evolution 60:2666-2666.

14bis.        Ravigné, V., I. Olivieri, S. C. Gonzalez-Martinez, and F. Rousset. 2006. Selective interactions between short-distance pollen and seed dispersal in self-compatible species. Evolution 60:2257-2271. LIEN

15.       Ravigné, V., I. Olivieri, and U. Dieckmann. 2004. Implications of habitat choice for protected polymorphisms. Evolutionary Ecology Research 6:125-145 PDF

16.       Kirkpatrick,M., and V. Ravigné. 2002. Speciation by natural and sexual selection: Models and experiments. The American Naturalist 159:S22-S35. LIEN

 

Chapitres d'ouvrages

1.            BarberousseA., Bierne N., Britton-Davidian J., Capy P., Desdevises Y., Giraud, T.,Jousselin E., Moulia C., Ravigné V., Samadi S., Smadja C. 2010. La spéciation. In: Thomas F., Lefèvre T., Raymond M., Biologie Evolutive : De Boeck. LIEN

 

Autres

Liste CIRAD des publications de Virginie Ravigné

 

Enseignement

               Introduction à la "Dynamique adaptative" - Module "Génétique et génomique évolutive" du Master 2 BGAE - Parcours BEE. Université Montpellier 2 - France

               Responsable du Module « Génétique et génomique évolutive » Master 1 BGAE - Parcours BEE. Université Montpellier 2 - France

 

Anciens étudiants et post-docs

Masters

               V. Calcagno 2001 Licence BPO. Univ. Montpellier 2

               J. Compan 2002 Maîtrise BPE. Univ. Montpellier 2

               A. Forté 2004 DEA Constituants élémentaires - Systèmes complexes. Univ. Paris 7

               A. Juigner 2011 Master 2 BGAE - Parcours DEPS. Univ. Montpellier 2

               H. Mathé-Hubert 2009 Master 1 BGAE - Parcours BEE. Univ. Montpellier 2

               M. Noreskal 2009 AgroParisTech

               B. Parisi 2006 DEA Systématique et Evolution. Université Paris 11

               G. Rousset 2002 Ecole Polytechnique

               B. Stojanova 2009 Master 1 BGAE - Parcours DEPS Univ. Montpellier 2

 

Thèses

               Audrey Andanson (Thèse ASC INRA 2007-2010 - Co-encadrée avec F. Halkett UMR IAM) Depuis 2010 - Post-doc UMR BIOGECO, Bordeaux

               Adrien Rieux (Thèse CIFRE Bayer 2008-2011 - Co-encadrée avec J. Carlier et L. de Lapeyre de Bellaire)

               Stéphanie Robert (Thèse CIRAD Région Languedoc-Roussillon  - Co-encadrée avec J. Carlier et C. Abadie) 2008-2012

 

 

Post-docs

               Benoit Barrès (post-doc CIRAD 2008-2009) Depuis 2009 - Post-doc UMR BIOGECO, Bordeaux 

               Eric Bazin (post-doc ANR 2008-2009) Depuis 2010 - Maître de Conférences, Université Joseph Fourier, Grenoble

 

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